Tidak bisa melakukan git init pada project laravel di cyberpanel

bagaimana ya caranya biar aplikasi laravel di cyberpanel terintegrasi dengan git. supaya ketika ada update terbaru, tidak perlu upload lagi, tinggal git pull saja. tetapi masalah yang saya alami yaitu tidak bisa karena project laravel kalo di upload ke server, ada dua folder yaitu laravel dan public_html. ketika saya melakukan git pull atau git init saja akan terjadi error karena foldernya terpisah. Mohon bantuannya teman2